Здравствуйте! Проверил работу memberof с репликацией на стенде: поставщик и потребитель репликации, на каждом отдельно настроено наложение memberof. При модификации записи группы (добавление нового атрибута member, удаление атрибута member) наложение memberof на поставщике и на потребителе отрабатывает нормально (в записи пользователей на обоих серверах, соответственно, появляется и исчезает атрибут memberOf). Так что видимых проблем с репликацией нет. Чтобы разобраться в конкретной внештатной ситуации, нужно смотреть логи.
Егор